孕期女工请假流程不合规，用人单位不能以此为由解除劳动合同。

根据相关法律规定和司法实践，即使在请假流程上存在问题，也应通过沟通解决，而不应直接导致劳动合同的解除。

此外，如果员工因病需要请假，应当按照公司的请假流程进行申请，否则公司可以以旷工为由解除劳动合同。

但是，这并不意味着所有情况下不合规的请假都可以成为解除劳动合同的理由，特别是当涉及到孕期女职工时，法律对其提供了更为严格的保护措施。

因此，除非存在严重违反规章制度等情形，否则仅因请假流程不合规而解除劳动合同是不符合法律规定的。