单位在调整怀孕女工岗位时，应遵循以下原则以保护她们的权益：

首先，必须与女职工协商一致，确保调岗是双方同意的结果。其次，对于法律禁止的岗位或能证明不适的岗位，用人单位应当进行调岗。

此外，根据医疗机构的证明，如果女职工在孕期不能适应原劳动，用人单位应减轻其劳动量或安排其他能够适应的工作。

同时，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退或解除劳动合同。最后，应为女性生育后的职业发展创造有利条件，禁止恶意调岗降薪等行为。